“最后晚餐”的场面到来了，男高音继续扮演福音史家的角色，他向人们叙述了犹大出卖老师的经过以及耶稣让门徒分食无酵饼和酒的事情。接下来的场景是“克西玛尼祷告”，在自己生命的最后一夜耶稣向上帝忏悔自己的软弱，当他三次发现门徒竟然沉睡不禁伤心难过，最后他战胜了恐惧，两位女低音演唱起耶稣的话语：“时候到了，人子被卖在罪人手里了。”
独唱男低音交代了犹大的背叛和耶稣的被捕，独唱男高音和女低音唱出了最后的词句：“当下，门徒都离开他逃走了！”（Alors les disciples l'abandonnerent et senfuirent）。整个第一部分的结尾采用了圣奥古斯丁《沉思录》中的一段，独唱与合唱相互配合唱起歌颂救世主的歌曲，乐队以进行曲的音型加以伴奏。至此，第一部分完成，根据马丁手稿上的记载完成日期是1946年1月5日，因此第一部分实际创作时间很短，远比后来的第二部分写得顺利。
第二部分从一段弦乐伴奏之上大管的沉闷独奏开始，气氛非常阴暗，独唱女低音进入，接着是合唱的应答，词句虽然优美，音调却十分凄凉，他们唱起“我欲举目四顾群山”，这段歌词同样出自圣奥古斯丁的《沉思录》，合唱团在这里被细分成八个声部。